Ingenieros de todo el mundo se han reunido cerca de la isla Hachijo-jima, Tokio, para la operación a gran escala de «Pacific Buoy», un nuevo sistema que conecta los sistemas de cámaras policiales de todo el mundo y permite el reconocimiento facial.

Mientras tanto, Conan y los Detective Boys visitan Hachijo-jima invitados por Sonoko y reciben una llamada telefónica de Subaru (un estudiante graduado en la Escuela de Ingeniería de la Universidad de Tohto, que es un agente del FBI, Shuichi Akai disfrazado) informándoles de que un empleado de la Europol ha sido asesinado en Alemania.

Conan se cuela en las instalaciones y descubre que una ingeniera ha sido secuestrada por la Organización de Negro, en busca de datos importantes en su unidad USB.