Protagonizó gran éxito de Doug Liman, el thriller El Caso Bourne, junto a Matt Damon. Potente impresionó al público de todo el mundo haciendo el personaje principal de la aclamada película de Tom Tyckwer Run Lola Run. Rodada en tiempo real, la historia sigue a Lola, una guapa punk de rojos cabellos, mientras corre por toda la ciudad durante unos agotadores veinte minuto intentando salvar los $20,000 que salvarán la vida de su novio. Run Lola Run ganó el Premio del Jurado en Sundance y el Premio a la Mejor Película Extranjera en los Independent Spirit Awards. También fue nominada al Premio a la Mejor Película de Habla No Inglesa en los BAFTA de 2000.

Potente co-protagonizó Blow, de Ted Demme, junto a Johnny Depp y Penélope Cruz. En 2001 también protagonizó La Princesa y el Guerrero, de Tom Tykwer, en la que encarnaba a la amante fuera de la ley de Benno Furmann.

Potente acaba de rodar en Alemania el film de ciencia-ficción Blueprint, dirigida por Rolf Schuble. Basada en la novela de Charlotte Kerner, Blueprint es la historia de una madre y su hija clonada.

Recientemente la vimos en Las Maletas de Tulse Luper: la Historia de Moab, el nuevo film de Peter Greenaway, tres películas de dos horas de duración que siguen la vida de Tulse Luper, un prisionero por vocación que reconstruye su vida utilizando las pruebas halladas en 92 maletas alrededor del mundo desde 1992 hasta 1989. El amplio reparto incluye también a Isabella Rossellini, Deborah Harry, Victoria Abril, Don Johnson, Nick Moran y J.J. Field.

Ha protagonizadoa otro gran éxito en Alemania, Anatomía, retomando su papel para la secuela, Anatomía 2. Después vendrían Blow, junto a Johnny Depp, Storytelling, Todo lo que Quiero, con Elijah Wood, y El Caso Bourn, con Matt Damon. Recientemente se ha reunido de nuevo con Matt Damon para El Mito de Bourne. Creep es la primera película británica de Franka Potente.

Entre los créditos germanos de Potente cabe destacar Nach Funf Im Urwals (1995), Coming In (1996), Rennlauf (1997), Opernball (1997), Bin Ich Schon (1997), Schlaranffenland (1998) y Der Krieger Un Die Kaiserin (2000).