Recientemente protagonizó Paycheck junto a Ben Affleck y Uma Thurman del director John Woo. Antes de ésta co-protagonizó junto a Jon Voight la película de Showtime "Jasper, Texas", Ali con Will Smith, Dragonfly - La Sombra de la Libélula con Kevin Costner y Algo que Contar con Benn Affleck y Gwyneth Paltrow. Morton fue uno de los narradores del documental de gran éxito "Jazz" de Ken Burn y del documental de ocho capítulos "Africa" en PBS.
Los aficionados al cine conocen a Morton por The Brother From Another Planet o como el desafortunado científico en Terminator 2. Sus otros trabajos en cine incluyen Love Star de John Sayles y Ciudad de Esperanza, Speed, Decisión Crítica, La Cara del Terror, Blues Brother 2000, Tap Dancing y De Ratones y Hombres de Gary Sinise.
Morton fue nominado al Tony por su papel de Walter Lee Younger en el musical "Raisin". Interpretó a Serge en "Art" con Judd Hirsch y George Wendt en Broadway y después en Londres.
Los telespectadores han disfrutado de los papeles protagonistas de Morton en las series "Equal Justice", "Under One Roof" con James Earl Jones y "Tribeca" (en la que también dirigió un episodio), así como un papel recurrente en "Smallville" de WB. Morton también ha hecho notables actuaciones como Malcolm X en "Ali: An Amercian Hero", en la película para el cable ganadora de premios "Miss EversŽ Boys" y como artista invitado en "The X Files".