Karl Yune posee descendencia asiática (coreano/mongol/japonés) pero nació y se crió en Washington D.C. Luego de terminar la escuela secundaria, Yune inició y vendió con éxito un emprendimiento en internet y fue aceptado por la Universidad Columbia para seguir la carrera de Negocios. Mientras estudiaba la obra de Shakespeare en un curso de Literatura decidió cambiar su carrera a Artes. Todavía como estudiante en Columbia, Yune ganó el papel de Romeo en una producción Off-Broadway de "Romeo y Julieta".

Así, continuó trabajando como actor de teatro en la ciudad de Nueva York y recibió elogios de la crítica por su actuación como Gloucester en una adaptación contemporánea de "Ricardo III", el clásico de Shakespeare. Durante las audiciones para seleccionar el elenco de The Last Samurai, el director Edward Zwick quedó impresionado con Yune y lo convocó a Los Ángeles para una reunión. Zwick informó posteriormente a Yune que el estudio debía seleccionar el reparto del film directamente en Japón, pero lo alentó a mudarse a Los Ángeles, puesto que detectó un gran talento en el joven actor.

Entusiasmado, Yune se mudó a California. Apenas llegó allí, recibió la noticia de que había sido seleccionado para trabajar en el popular programa dramático de TV "All My Children", en Nueva York. Yune rechazó la oferta pero rápidamente logró su primer protagónico en el film de culto Anacondas: The Hunt for the Blood Orchid. Al año siguiente fue elegido por el productor Steven Spielberg para interpretar a Koichi, el amante secreto de la geisha Hatsumomo en Memoirs of a Geisha, la película basada en la novela de fama internacional.

Yune continúa trabajando en papeles protagónicos y de reparto en películas independientes, extranjeras y realizadas en Hollywood. Vive en Santa Mónica, California, y está feliz con su papel más emotivo: ser padre de una niñita recién nacida. Su hermano, Rick, también es un exitoso actor de Hollywood.